民國四十五年本縣三灣、南庒、獅潭等三鄉鎮地屬偏遠，均無一所中學，國小畢業生有意升學者需遠赴竹南中學等外鄉鎮報考就讀，擠車勞累且費時耗財至為不便，地方熱心教育人士，有鑑及此，乃倡議爭取籌設初中，同年三月間成立「苗栗縣立竹南中學三灣分部籌建委員會」，公推當時鄉長張居明先生、縣議員廖龍生、曾坤玉先生及熱心教育仕紳林順昌、盧阿來、黃鈺明等先生為籌建委員并推張鄉長居明先生為主任委員，積極進行設校工作并商借黃鈺明先生私宅為辦事處，同年八月竹南中學奉令成立三灣分部籌備處，遴派本鄉出身任教於該校教學組長張國文先生負責籌備招生工作，招收新生二班計八十九名新生，九月暫借三灣國小教室三間，作為上課及辦公之用。

      民國四十五年十月十八日正式奉准設立「苗栗縣立竹南初中三灣分部」，縣府派劉漢源先生為分部主任，至此鄉民期盼設立中學之宿願乃告實現。

      民國四十五年建校之初，首期洽購鄉民李昂古私有土地一筆零．七四六九公頃，計價新臺幣九六、八八五元。

      民國四十六年八月再招生二班計八十八名，因興建校舍工程延誤復商借三灣製茶工廠上課，迨至四十七年二月校舍工程竣工，始遷入新校舍上課，並於五月四日舉行校舍落成典禮，師生從此不再寄人籬下。

      復於民國四十八年為配合獨立設校，蒙時任會長之邱盛明先生奔走協助再加購李昂古先生私有土地零．七七九八公頃，計價新臺幣一零六、九六九元，合計兩筆土地一．五二六七公頃為校地。民國四十八年十二月三日奉省府核准獨立設校正名為「苗栗縣立三灣初級中學」，縣府派原分部主任劉漢源先生為首任校長，並於49年3月10日舉行成立典禮。

      民國五十七年秋，政府明令實施九年國教，同年八月校名易為「苗栗縣立三灣國民中學」，仍由劉漢源先生續任校長，繼續擴充建制，充實設備建樹良多。

      身為三灣鄉最高學府的三灣國中，在歷任校長、家長會長、社區人士和全體師生共同努力下，不論對外各項比賽或是學生的學習成就，均秉持「多給孩子機會，多給學生舞台」的教育理念，全力以赴，不放棄每個孩子，冀望在三灣鄉「友善、勤奮」的良好鄉風中，再造三灣國中卓越的優良校風。